Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc71Q8VEG0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms