Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cul7Q8VE73 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul7Q8VE73 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms