Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Smg8Q8VE18 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Smg8Q8VE18 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Smg8Q8VE18 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Smg8Q8VE18 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Smg8Q8VE18 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Smg8Q8VE18 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Smg8Q8VE18 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Smg8Q8VE18 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Smg8Q8VE18 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smg8Q8VE18 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms