Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef3Q8VCC8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef3Q8VCC8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms