Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops8Q8VBV7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops8Q8VBV7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms