Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmpQ8R373 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms