Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc12Q8R344 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms