Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms