Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hecw1Q8K4P8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hecw1Q8K4P8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms