Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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