Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MyripQ8K3I4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms