Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scara5Q8K299 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scara5Q8K299 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scara5Q8K299 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scara5Q8K299 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scara5Q8K299 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scara5Q8K299 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scara5Q8K299 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scara5Q8K299 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scara5Q8K299 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scara5Q8K299 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scara5Q8K299 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scara5Q8K299 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scara5Q8K299 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scara5Q8K299 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scara5Q8K299 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms