Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Gtf3c1Q8K284 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Gtf3c1Q8K284 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gtf3c1Q8K284 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Gtf3c1Q8K284 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gtf3c1Q8K284 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gtf3c1Q8K284 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Gtf3c1Q8K284 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Gtf3c1Q8K284 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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Gtf3c1Q8K284 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Gtf3c1Q8K284 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c1Q8K284 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c1Q8K284 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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Gtf3c1Q8K284 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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Gtf3c1Q8K284 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
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