Protein–RNA interactions for Protein: Q8K215

Lyrm4, LYR motif-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm4Q8K215 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lyrm4Q8K215 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lyrm4Q8K215 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lyrm4Q8K215 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lyrm4Q8K215 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lyrm4Q8K215 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lyrm4Q8K215 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lyrm4Q8K215 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lyrm4Q8K215 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lyrm4Q8K215 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms