Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek9Q8K1R7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Nek9Q8K1R7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek9Q8K1R7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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