Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Cldn34c1Q8K193 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Cldn34c1Q8K193 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Cldn34c1Q8K193 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Cldn34c1Q8K193 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Cldn34c1Q8K193 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Cldn34c1Q8K193 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c1Q8K193 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Cldn34c1Q8K193 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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