Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp1Q8K021 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms