Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Mterf1aQ8CHZ9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Mterf1aQ8CHZ9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Mterf1aQ8CHZ9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Mterf1aQ8CHZ9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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