Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh4a1Q8CHT0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh4a1Q8CHT0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms