Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip3Q8CHD8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms