Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Csnka2ipQ8CH19 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Csnka2ipQ8CH19 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Csnka2ipQ8CH19 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Csnka2ipQ8CH19 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Csnka2ipQ8CH19 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Csnka2ipQ8CH19 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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