Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFU0

Tmem198b, Transmembrane protein 198b, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem198bQ8CFU0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem198bQ8CFU0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem198bQ8CFU0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem198bQ8CFU0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem198bQ8CFU0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem198bQ8CFU0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem198bQ8CFU0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem198bQ8CFU0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem198bQ8CFU0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem198bQ8CFU0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem198bQ8CFU0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem198bQ8CFU0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem198bQ8CFU0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem198bQ8CFU0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem198bQ8CFU0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem198bQ8CFU0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms