Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc28bQ8CEG5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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