Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef8Q8CE24 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pramef8Q8CE24 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pramef8Q8CE24 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pramef8Q8CE24 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pramef8Q8CE24 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pramef8Q8CE24 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pramef8Q8CE24 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef8Q8CE24 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms