Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nhlrc3Q8CCH2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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