Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Vwa8Q8CC88 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Vwa8Q8CC88 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Vwa8Q8CC88 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Vwa8Q8CC88 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Vwa8Q8CC88 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Vwa8Q8CC88 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Vwa8Q8CC88 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Vwa8Q8CC88 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Vwa8Q8CC88 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Vwa8Q8CC88 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Vwa8Q8CC88 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Vwa8Q8CC88 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms