Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fbxo48Q8CAT8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms