Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms