Protein–RNA interactions for Protein: Q8C850

Scara3, Scavenger receptor class A member 3, mousemouse

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Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara3Q8C850 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Scara3Q8C850 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Scara3Q8C850 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Scara3Q8C850 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scara3Q8C850 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms