Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dclre1bQ8C7W7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms