Protein–RNA interactions for Protein: Q8C503

Sit1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sit1Q8C503 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sit1Q8C503 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sit1Q8C503 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms