Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Snx16Q8C080 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Snx16Q8C080 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Snx16Q8C080 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Snx16Q8C080 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Snx16Q8C080 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Snx16Q8C080 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Snx16Q8C080 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Snx16Q8C080 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Snx16Q8C080 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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