Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc44a2Q8BY89 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms