Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWW4

Larp4, La-related protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp4Q8BWW4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Larp4Q8BWW4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Larp4Q8BWW4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms