Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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TtpaQ8BWP5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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TtpaQ8BWP5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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TtpaQ8BWP5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TtpaQ8BWP5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TtpaQ8BWP5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TtpaQ8BWP5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TtpaQ8BWP5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TtpaQ8BWP5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms