Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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Usp38Q8BW70 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Usp38Q8BW70 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
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Usp38Q8BW70 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp38Q8BW70 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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