Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4aQ8BU40 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp4aQ8BU40 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms