Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BP99 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BP99 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BP99 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BP99 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BP99 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BP99 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BP99 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Q8BP99 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Q8BP99 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BP99 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BP99 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BP99 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BP99 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BP99 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Q8BP99 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BP99 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BP99 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BP99 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BP99 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Q8BP99 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Q8BP99 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Q8BP99 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Q8BP99 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Q8BP99 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Q8BP99 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Q8BP99 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BP99 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BP99 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Q8BP99 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Q8BP99 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BP99 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Q8BP99 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Q8BP99 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Q8BP99 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Q8BP99 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Q8BP99 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BP99 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BP99 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BP99 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BP99 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BP99 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BP99 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BP99 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BP99 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8BP99 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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