Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms