Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc4Q8BKW4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms