Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp1Q8BJQ2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp1Q8BJQ2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp1Q8BJQ2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp1Q8BJQ2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp1Q8BJQ2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp1Q8BJQ2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp1Q8BJQ2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp1Q8BJQ2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms