Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rspo4Q8BJ73 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rspo4Q8BJ73 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms