Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rufy1Q8BIJ7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rufy1Q8BIJ7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms