Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cyp4f39Q8BGU0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms