Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms