Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG67

Efr3a, Protein EFR3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3aQ8BG67 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Efr3aQ8BG67 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Efr3aQ8BG67 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Efr3aQ8BG67 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Efr3aQ8BG67 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Efr3aQ8BG67 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efr3aQ8BG67 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Efr3aQ8BG67 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Efr3aQ8BG67 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efr3aQ8BG67 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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