Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmtc4Q8BG19 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms