Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M10.4Q85ZW8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms