Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfascQ810U3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms