Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem39bQ810L4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem39bQ810L4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms